진리, 자유, 봉사의 부산대학교 교학이념을 바탕으로 지역사회와 국가 및 인류공동체의 발전에 기여할 수 있는 유능한 약학연구자의 양성을 목적으로 한다.

1. 약학연구자로서 창의력과 탐구정신을 가지고 질병의 예방과 치료 및 국민보건 증진에 기여할 수 있는 인재를 양성한다.
2. 약학연구자로서 약학에 대한 깊이 있는 이해와 활용능력으로 새로운 지식 창출과 우수한 의약품 개발 등의 약학 연구를 선도할 수 있는 인재를 양성한다.
3. 약학연구자로서 지역사회 및 국가의 발전을 위하여 지도자로의 자질을 갖춘 인재를 양성한다.
4. 약학연구자로서 전문적인 연구개발 능력과 폭넓은 시각으로 국제화 시대에 경쟁력 있는 인재를 양성한다.
5. 약학연구자로서 윤리의식과 사회 봉사정신을 겸비한 훌륭한 인력의 인재를 양성한다.